Pagani Zonda je u zvaničnom press materijalu objavio da je Zonda R plod želje njihovih zahtevnih kupaca, kojima je trebao automobil konstruisan isključivo za trkačku stazu.
Zonda R deli samo 10% komponenti sa Zondom F. Neke od osobenosti Zonda R su monokok od ugljeničnih vlakana, avional ogibljenje, izuzetno lagan usisni sistem od ugljeničnih vlakana, izduv u stilu onih kod bolida Formule 1 i novi 6-stepeni, sekvencijalni menjač. Međuosovinsko rastojanje je duže za 47 mm, ukupna dužina za 394 mm, a trag točkova za 50 mm što bi trebalo doprineti mnogo boljoj stabilnosti u krivinama.
Motor je baziran na onom iz Mercedesa CLK GTR koji je osvojio FIA GT šampionat. Motor su prilagodili inženjeri AMG-a, a razvijaće 750 Ks pri 8000 ob/min i maksimalnih 710 Nm obrtnog momenta.
Vrlo važna stvar bila je pripitomiti motor kako bi mu servis bio neophodan na svakih 5000 km.
Hauba automobila je nešto duža, a tu su i podešavajući stabilizatori napred i pozadi, kao i difuzor koji će u kombinaciji sa celokupnom aerodinamikom vozila omogućiti neverovatne brzine u krivinama.
Moguća cena ovog užitka za prebogate klijente biće oko 1,2 miliona dolara + porez.