I ako je još u ranoj fazi razvoja prototip nove Yamahe R1 ugledao je svetlost dana na pisti Phillip Island gde je Yamaha neuspešno pokušala da sakrije litarsku mašinu iza oplate modela R6.
Ako se pažljivije pogleda ispod privremene oplate se primećuje da se radilo na položaju agregata u samom ramu pre svega zahvaljujući više postavljenoj radilici što je opet omogućilo niže postavljanje izduva po uzoru na R6 i M1. Nova pozicija izduva, sa velikim kolektorom ispod agregata, svedoči o pokušaju veće centralizacije mase što je opet dovelo do pomeranja oslonca zadnje vile koja je u dosadšnjim R1 bila montirana prilično nisko što je zadnjem ogibljenju donekle otežavalo posao.
Prednji kraj je takođe pretrpeo izmene pa se tako primećuje da je ugao prednjih vila nešto veći što će dati bolju stabilnost pri velikim brzinama dok jedan airbox, do sada je R1 imala dva bočno postavljena, svedoči o trkačkim aspiracijama pošto je WSBK klasa postala mnogo konkurentnija i preuzeta od strane evropskih proizvođača. O agregatu se za sada još ništa sigurno ne zna ali se po zvuku zaključuje da nema prevelikih mehaničkih promena u odnosu na aktuelni model. Zanimljivost je što je prototipu R1 društvo na pisti pravio najnoviji model BMW S1000RR takođe vožen od strane Yamaha test vozača.
